曾任民进江苏省委副主委。
1964年11月，出生在余姚市鹿亭乡晓云村。
1984年，从宁波师范学院（现宁波大学）物理系毕业，之后留校任教。
1990年，从苏州大学物理系研究生毕业，获得硕士学位 ；同年，考取南京大学博士研究生，师从理论物理学家龚昌德院士。
1993年，从南京大学毕业，获得理学博士学位，之后留校任教；1993年7月，破格晋升南京大学物理学副教授；
1995年，晋升南京大学物理学教授；
1997年，列入教育部跨世纪优秀人才培养计划；
1999年，荣获国家杰出青年科学基金；
2007年4月，加入中国民主促进会 ；
2011年，入选江苏省第四期“333高层次人才培养工程”第二层次培养对象；
2021年11月，当选为中国科学院院士；
2022年6月，民进江苏省委主任委员；
2022年12月，当选中国民主促进会第十五届中央委员会委员、常务委员；
2023年1月，当选政协江苏省第十三届委员会副主席。
现任江苏省政协常委、副主席，民进中央委员、江苏省委会主委，南京大学校务委员会副主任委员、博士生导师，中科院院士。
政协江苏省第十三届委员会委员，中国人民政治协商会议第十四届全国委员会委员。
2017年6月，民进江苏省第十届委员会第一次全体会议上，马余强当选为副主任委员。
2022年6月15日，中共江苏省委组织部发布任免信息，马余强拟任正厅级干部。
2022年6月27日至29日，民进江苏省第十一次代表大会，选举马余强为主委。
2023年1月18日，政协江苏省第十三届委员会第一次会议上，马余强当选为江苏省政协副主席。
生命活性物质的非平衡统计物理
细胞与纳米材料的相互作用
高分子胶体凝聚态结构组织和动力学
聚态物理、胶体结晶、生物膜结构组织和细胞骨架的非平衡自组织等若干前沿领域取得了有意义的成果。
2000年以来发表国际知名学术刊物论文百余篇，包括以通信联系人身份发表论文在国际权威刊物如英国《自然》系列Nature Nanotechnology，美国国家科学院院刊（PNAS）和化学类顶级刊物如美国化学会志JACS等。一些论文被SCIENCE，JACS，PRL，Nano Lett.和Angew. Chem. Int. Ed.等期刊引用，高的学术评价。
多次在国际、国内重要学术会议作特邀报告，如应邀在国际生物分子和材料模拟会议做大会报告，国际高分子物理会议做邀请报告，全国高分子材料会议做大会报告，以及应邀访问美国麻省大学和康州大学的高分子科学系并做演讲等。担任中美前沿科学研讨会软物质专题主席，以及多次负责组织中国高等科学技术中心软物质物理工作月等重要学术会议和多次负责过中国物理学年会的软凝聚态物理、生物和交叉领域分会等等。
主持过国家杰出青年科学基金，国家自然科学基金重点项目、教育部跨世纪优秀人才基金、霍英东基金、国家自然科学基金理论物理重要课题、海外杰出青年学者合作基金、国家自然科学基金重大研究计划项目多项子课题等国家级项目十多项。
已培养博士毕业研究生30余位，许多在美国从事工作或博士后研究，另有近10位学生博士毕业或博士后出站后在国内高校成为教授。
.项目名称：复杂液体的相分离、动力学演化和结构有序化研究
（国家杰出青年科学基金）
2.项目名称：多层神经网络的学习机理和蛋白质折叠的动力学
（国家教委“跨世纪优秀人才培养计划”基金）
3.项目名称:软物质理论:超分子溶液分离和胶体晶化动力学
（国家自然科学基金理论物理重要课题）
4.项目名称：低维磁系统的量子临界行为
（第五届霍英东青年教师基金）
5.项目名称：无序量子铁磁和反铁磁性自旋玻璃相的研究
（国家自然科学基金）
6.项目名称：淬火无序量子磁系统的相变理论研究
（国家教委博士点专项基金）
7.项目名称：超分子溶液的相分离
（江苏省“青蓝工程”跨世纪学术带头人培养基金）
8.项目名称：聚合物和复杂流体
（国家自然科学基金重大研究计划项目``理论物理学及其科学
若干前沿问题”子项目）
9.项目名称：软凝聚态物质研究
（国家自然科学基金重点项目）
10.项目名称：复杂液体在受限下的相有序行为
（国家自然科学基金面上项目）
11.项目名称：聚合物凝聚态的多尺度连贯研究
（国家自然科学基金重大项目）
2021年11月18日，中国科学院公布2021新当选院士名单，马余强在列。
2021年8月1日，中国科学院公布2021年中国科学院院士增选初步候选人名单，马余强在列。
